מחלקת עיניים בבי"ח בני ציון מציעה טיפול אשפוזי, אמבולטורי וניתוחי במגוון תחומים הקשורים ברפואת עיניים ע"י רופאים בכירים שהתמחו בתחומים שונים. למחלקה גם מרפאת חוץ פעילה וכן שירות למקרים המגיעים דרך חדר מיון.
המחלקה מנוספת לביה"ס לרפואה של הטכניון מכשירה מתמחים וכן עוסקת בהוראה לסטודנטים לרפואה מהארץ ומחו"ל.
פרופ' אליהו ניימן אשר הגיע מהדסה יסד את מחלקת העיניים בשנת 1964 וניהל אותה עד 1991. לאחר פרישתו של פרופ' צבי פרידמן אשר ניהל את המחלקה משנת 1991 ועד 2002 , נכנס לתפקיד פרופ' חנא גרזוזי שעבר מעפולה (העמק) בשנת 2002 ומנהל עד היום את המחלקה.
מזה כ- 40 שנים מקיימת מחלקת עיניים של המרכז הרפואי בני-ציון, בשיתוף עם משרד הבריאות, סקר בקרב אוכלוסיית הפעוטות בנפת חיפה, שמטרתו אבחון וטיפול מוקדם במחלות עיניים מולדות בעיקר פזילה, עין עצלה והפרעות תשבורת. הפרעות אלה, אם יאובחנו בזמן ומוקדם במידת האפשר יקטינו בעיות תפקודיות והפרעות למידה.
הסקר התחיל באוקטובר 1968 ונמשך עד עצם היום הזה. בסקר זה נבדקים כל הילדים אשר מגיעים לגיל שנה (החל מילידי מאי 1967) עם טווח גילאים הנע בין שנה ושנתיים וחצי. צוות הבודקים מורכב מרופאי עיניים ואורטופטיסטים מיומנים ממחלקת עיניים של בני-ציון. עד סוף 2003 נבדקו 233,237 ילדים (בממוצע 6664 ילדים בשנה). הישובים בהם מתנהל הסקר הם: חיפה, דלית הכרמל, עוספיה, טירת הכרמל, נשר, טבעון, קרית עמל, קרית אתא, קרית ביאליק, קרית מוצקין, קרית ים, חילף וחואלד. הבדיקות מתפרסות על פני 55 תחנות טיפת חלב בישובים אלה.
תחומי פעילות - ניתוחים
ניתוח ירוד (קטרקט) והשתלת עדשות תוך עיניות
ניתוחי גלאוקומה בשיטות שונות, כולל מסתמים
ניתוחי רשתית וזגוגית (ויטרקטומיה) והזרקות תוך עיניות
ניתוחי פזילה
ניתוחי ארובה ועפעפיים
מרפאות
מרפאת רשתית
מרפאת גלאוקומה
מרפאת נוירואופתלמולוגיה
מרפאת ארובה ואוקולופלסטיקה
מרפאת קטרקט
מרפאת קרנית
מרפאת גנטיקה עינית
מרפאת עיניים כללית
יחידות
אוטראופטיקה
הדמיה ובדיקות עזר
שדות ראיה ממוחשבים
מיפוי קרנית
בדיקת עובי קרנית
בדיקות OCT לבעיות רשתית וגלאוקומה