רופאי המכון מטפלים בבעיות מגוונות של בלוטת התריס ויותרת התריס כגון הפרעות בפעילות, אבחון גידולים סרטניים, טיפול ומעקב. הדבר נעשה תוך שיתוף פעולה עם המכון הפתולוגי, המבצע ניקור בלוטת תריס במחט עדינה תחת אולטרה - סאונד, עם המחלקה הכירורגית, בה מבוצעים ניתוחי תריס ויותרת התריס ועם המכון האיזוטופי למתן יוד רדיואקטיבי (עם אפשרות לאשפוז) בעת הצורך.

רופאי המכון עוסקים במיוחד במחלות יותרת הכליה (אדרנל) - כגון תסמונת קושינג, תת פעילות יותרת הכליה וסרטן יותרת הכליה. למכון מופנים חולים הסובלים ממחלות אלו לאישור אבחנה ולטיפול ממרפאות ומכונים אנדוקריניים בחיפה וברחבי הארץ.
רופאי המכון פרסמו כ- 20 מאמרים בנושאים אלה בספרות העולמית המובילה, וכ- 30 תקצירים בנושאים אלו בכנסים בארץ ובארה"ב.

בנושאים של אוסטאופורזיס נעשית הערכה של חולים עם סיכון גבוה למחלה, המלצות לטיפול, טיפולים תוך ורידיים בתכשירים חדישים (אקלסטה) ושיתוף פעולה עם המחלקה האורטופדית בחולים לאחר שברים מורכבים.

השרות לחולי סוכרת מיועד לכלל חולי הסוכרת כולל חולים עם סוכרת טיפוס 1 (סכרת צעירים), טיפוס 2 (סכרת מבוגרים) וסכרת לאחר ניתוחי בטן (לבלב וכו'). בנוסף, מקיימת היחידה ברורים במקרים של רמות סוכר נמוכות בדם (היפוגלוקמיות). העבודה כוללת שיתוף פעולה מלא ותאום עם מחלקת עיניים, אורטופדיה של כף הרגל, המחלקה הנפרולוגית, המחלקה לכירורגית כלי דם והיחידה לתזונה ודיאטה.

במסגרת השירות, החולים עוברים הערכה של מחלת הסוכרת, הסיבוכים, גורמי סיכון נלווים ונבדקת הרזרבה של אינסולין בלבלב. השרות כולל הערכה ע"י רופא מומחה והדרכה בנושאי תזונה, טיפולים תרופתיים חדישים, טיפול באינסולין, משאבת אינסולין ואביזרים הקשורים למחלה.

המכון האנדוקריני כולל מעבדה המבצעת את רוב בדיקות הרוטינה באנדוקרינולוגיה עבור החולים המאושפזים בבית החולים, חולי המרפאה ועבור בתי חולים אחרים בסביבה. בין היתר, מבצעת המעבדה בדיקות מיוחדות כגון ACTH - לברור תפקוד יותרת המוח, PTH תוך כדי ניתוחים להסרת בלוטות פרה- תאירואיד, תירוגלובולין- למעקב אחרי חולי סרטן בלוטת התריס ועוד.

יש להדגיש כי רוב בדיקות המעבדה, כולל תפקודי תריס ויותרת הכליה, מתקבלות ביום הפנייה למרפאה, דבר המאפשר טיפול יעיל ומהיר.
המכון האנדוקריני מוכר ע"י המועצה המדעית להתמחות מלאה.